随着人们生活水平的提供和生活方式的改变，以及施用方便、增产显著的无机化肥工业的发展，“脏、烂、臭”的农家肥越来越受到现代农民的冷落。因此，从目前的施肥结构上来看，重无机、轻有机的施肥习惯非常普遍，特别是在粮食作物生产中长此以往，势必会破坏土壤结构，导致土壤板结，土壤肥力下降。
腐植酸可以促进土壤团粒结构的形成，降低土壤容重，提高阳离子代换量，调节土壤酸碱度，从而有助于提高土壤的保水、保肥、保温和通气能力。
氮磷钾肥料的施用在提高农产品产量方面固然发挥了决定性的作用，但高产不高效现象已经成了我国作物高产超高产栽培中普遍存在的主要问题。如何加强养分资源的综合管理，提高肥料的利用率，正成为现代农业管理体系中的研究的重点。
而腐植酸的控氮缓释、解磷增效、防钾淋失、活化微量营养元素的多重作用就显得尤为重要了，能大大提高肥效，均衡营养供给。腐植酸叶面肥作为农药的良好助剂主要体现在以下几个方面：
(1) 腐植酸是由复杂的有机物组成，分子中含有较多的亲水、亲油基团，具有表面活性剂的作用，与农药混合，能有效的发挥其良好的分散、乳化作用，从而提高农药活性，增加农药药效。
(2) 腐植酸具有很大的比表面积，对有机-无机物均有很强的吸附作用，与农药配伍，会形成一些配合体，从而起到使药效缓慢释放的效果。
(3) 由于腐植酸分子官能团中含有氨基、S-基，可降低农药对人畜的毒害作用，从而在一定程度上提高农药施用后的安全性。
腐植酸类物质本身就具有类似农药的功能。有研究表明，喷施腐植酸叶面肥后，辣椒青枯病发病率、花生锈病发病率、烂果率等显著降低。
农产品的安全生产，农业产地的环境质量首当其冲。腐植酸富含有羧基和酚羧等活性官能团，其对金属离子、有机污染物的强吸附作用，对缓解重金属和有机污染意义重大。有研究表明，在每升含50mg汞的溶液中，在pH=2时，泥炭对汞的吸附量可以达到90%，在氨水溶液中对铜的吸附量可达到100%。
腐植酸可以通过疏水作用、配位交换和氢键作用等吸附多环芳烃、多氯联苯、农药、除草剂等有机污染物，通过固定沉淀作用，降低其在环境中的活性浓度，减轻其对环境的污染;也可以通过氧化还原作用，将大子有机化合物降解为小分子有机化合物。
此外，施入土壤后，还可以通过刺激土壤中微生物和酶的活性，提高土壤的自净能力，从而间接促进有机物的降解;或通过促进植物的生长以及植物体本身生理代谢机能的改变，增强植物对有机污染物的降解和净化能力。
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